蛋白質(zhì)序列(蛋白質(zhì)序列是什么)

蛋白質(zhì)序列是什么意思？

蛋白質(zhì)中基本氨基酸只有二十種。若有其他氨基酸，也都是二十種基本氨基酸經(jīng)過修飾得來的。不知樓主學(xué)過生化嗎？氨基酸基本結(jié)構(gòu)是一樣的，區(qū)別只在于R基。就是說，二十種基本氨基酸只意味著二十種R基。序列中的數(shù)字就代表殘基的順序，每行60個(gè)殘基，從第一個(gè)到第60個(gè)。一行肽鏈有三個(gè)氨基酸，殘基也只有三個(gè)呀，一個(gè)殘基指的是氨基酸形成肽鍵（要脫去一個(gè)羥基和一個(gè)氫）后的剩余部分。一號(hào)殘基就是第一個(gè)氨基酸脫去羥基的部分。肽鏈的順序是從N端到C端。

蛋白質(zhì)序列功能域

一條蛋白質(zhì)序列中的一段保守區(qū)域，該區(qū)域能夠獨(dú)立行使功能、進(jìn)化等。
在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)中，是一個(gè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的一部分，能形成一個(gè)緊密的三級(jí)結(jié)構(gòu)，能獨(dú)立折疊且結(jié)構(gòu)穩(wěn)定，同樣具有獨(dú)立功能和進(jìn)化等特征。

目的：除了多序列聯(lián)配的結(jié)果，用更好的方式描述功能域并應(yīng)用。

多序列聯(lián)配結(jié)果中每一列出現(xiàn)最多的堿基或氨基酸構(gòu)成的序列，是一條單一序列。

把每一列出現(xiàn)的堿基或氨基酸都列出而形成的。

是一個(gè)類似PSSM的矩陣，但它可以包含匹配、錯(cuò)配、插入和缺失等情況。提供了多序列聯(lián)配中每一列出現(xiàn)各種氨基酸（或空格）的概率（經(jīng)過對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換并取整數(shù)）。

用參數(shù)表示的用于描述隨機(jī)過程統(tǒng)計(jì)特性的概率模型，是一個(gè)雙重隨機(jī)過程，由兩部分組成：馬爾可夫鏈和一般隨機(jī)過程。
詳情見書P381

信息量IC=2-H（H越大，IC越低）

基因的蛋白質(zhì)編碼序列是什么序列?

基因的蛋白質(zhì)編碼序列是CDS序列，可以叫coding gment或coding quence。這條序列從ATG啟動(dòng)密碼子開始，終止密碼子結(jié)束。

所有的CDS都是ORF（開發(fā)閱讀框 open reading framework），ORF就是ATG開始，終止密碼子結(jié)束的一條序列，但ORF不一定編碼蛋白，這是它和CDS的區(qū)別，只有編碼蛋白的ORF才是CDS。

對(duì)于真核生物來說，mRNA是由外顯子組成的。真核生物在轉(zhuǎn)錄后產(chǎn)生核不均一RNA（hnRNA）經(jīng)過修飾加工可變剪切（除去內(nèi)含子）形成成熟mRNA。

原核生物則不需要。所以在生物信息學(xué)中單純使用查找ATG的方式找ORF只適合原核生物或mRNA，真核有專門的基因預(yù)測(cè)軟件。

基因（遺傳因子）是產(chǎn)生一條多肽鏈或功能RNA所需的全部核苷酸序列。基因支持著生命的基本構(gòu)造和性能。儲(chǔ)存著生命的種族、血型、孕育、生長(zhǎng)、凋亡等過程的全部信息。

環(huán)境和遺傳的互相依賴，演繹著生命的繁衍、細(xì)胞分裂和蛋白質(zhì)合成等重要生理過程。生物體的生、長(zhǎng)、衰、病、老、死等一切生命現(xiàn)象都與基因有關(guān)。

它也是決定生命健康的內(nèi)在因素。因此，基因具有雙重屬性：物質(zhì)性（存在方式）和信息性（根本屬性）。

蛋白質(zhì)的一二三四級(jí)結(jié)構(gòu)是什么？

蛋白質(zhì)四級(jí)結(jié)構(gòu)

（1）一級(jí)結(jié)構(gòu)指形成肽鏈的氨基酸序列，即氨基酸殘基的排列順序。

（2）二級(jí)結(jié)構(gòu)多肽鏈盤繞形成規(guī)律性結(jié)構(gòu)。

（3）三級(jí)結(jié)構(gòu)多肽鏈三維構(gòu)象，在二級(jí)結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上，進(jìn)一步折疊成復(fù)雜分子結(jié)構(gòu)。

（4）四級(jí)結(jié)構(gòu)數(shù)條完整三級(jí)結(jié)構(gòu)多肽鏈連接而成聚合體結(jié)構(gòu)。

蛋白質(zhì)的作用

構(gòu)造人體：蛋白質(zhì)是細(xì)胞組成的必要成分，是人體結(jié)構(gòu)組織的主要物質(zhì)，人體的毛發(fā)、肌肉、骨骼、內(nèi)臟等都離不開蛋白質(zhì)。

供能：蛋白質(zhì)可以為人體的生命活動(dòng)提供能量，保證營(yíng)養(yǎng)供給。

載體：蛋白質(zhì)可以在體內(nèi)運(yùn)輸各種物質(zhì)，如氧氣、各種離子等，維持人體的生命活動(dòng)。

免疫：蛋白質(zhì)具有免疫功能，人體的抗體就是由蛋白質(zhì)構(gòu)成，有助于幫助人體抵抗感染。

以上內(nèi)容參考 百度百科--蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)

蛋白質(zhì)的一二三四級(jí)結(jié)構(gòu)是什么？

一級(jí)結(jié)構(gòu)：蛋白質(zhì)多肽鏈中氨基酸的排列順序，以及二硫鍵的位置。

二級(jí)結(jié)構(gòu)：蛋白質(zhì)分子局區(qū)域內(nèi)，多肽鏈沿一定方向盤繞和折疊的方式。

三級(jí)結(jié)構(gòu)：蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上借助各種次級(jí)鍵卷曲折疊成特定的球狀分子結(jié)構(gòu)的空間構(gòu)象。

四級(jí)結(jié)構(gòu)：多亞基蛋白質(zhì)分子中各個(gè)具有三級(jí)結(jié)構(gòu)的多肽鏈，以適當(dāng)?shù)姆绞骄酆纤纬傻牡鞍踪|(zhì)的三維結(jié)構(gòu)。

蛋白質(zhì)是以氨基酸為基本單位構(gòu)成的生物大分子。蛋白質(zhì)分子上氨基酸的序列和由此形成的立體結(jié)構(gòu)構(gòu)成了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的多樣性。蛋白質(zhì)具有一級(jí)、二級(jí)、三級(jí)、四級(jí)結(jié)構(gòu)，蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)決定了它的功能。

蛋白質(zhì)（protein）是組成人體一切細(xì)胞、組織的重要成分。機(jī)體所有重要的組成部分都需要有蛋白質(zhì)的參與。一般說，蛋白質(zhì)約占人體全部質(zhì)量的18%，最重要的還是其與生命現(xiàn)象有關(guān)。

蛋白質(zhì)是生命的物質(zhì)基礎(chǔ)，是有機(jī)大分子，是構(gòu)成細(xì)胞的基本有機(jī)物，是生命活動(dòng)的主要承擔(dān)者。沒有蛋白質(zhì)就沒有生命。氨基酸是蛋白質(zhì)的基本組成單位。它是與生命及與各種形式的生命活動(dòng)緊密聯(lián)系在一起的物質(zhì)。

機(jī)體中的每一個(gè)細(xì)胞和所有重要組成部分都有蛋白質(zhì)參與。蛋白質(zhì)占人體重量的16%~20%，即一個(gè)60kg重的成年人其體內(nèi)約有蛋白質(zhì)9.6~12kg。人體內(nèi)蛋白質(zhì)的種類很多，性質(zhì)、功能各異，但都是由20種氨基酸（Amino acid）按不同比例組合而成的，并在體內(nèi)不斷進(jìn)行代謝與更新。

蛋白質(zhì)序列的意思？？

蛋白質(zhì)序列測(cè)定技術(shù)先于DNA序列測(cè)定技術(shù)問世，蛋白質(zhì)序列的搜集也早于DNA序列。蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)的雛形可以追溯到60年代。60年代中期到80年代初，美國(guó)國(guó)家生物醫(yī)學(xué)研究基金會(huì)(National Biomedical Rearch Foundation，簡(jiǎn)稱NBRF)Dayhoff領(lǐng)導(dǎo)的研究組將搜集到的蛋白質(zhì)序列和結(jié)構(gòu)信息以“蛋白質(zhì)序列和結(jié)構(gòu)地圖集”(Atlas of Protein Sequence and Structure)的形式發(fā)表，主要用來研究蛋白質(zhì)的進(jìn)化關(guān)系。1984年，“蛋白質(zhì)信息資源”(Protein Information Resource，簡(jiǎn)稱PIR)計(jì)劃正式啟動(dòng)，蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)PIR也因此而誕生。與核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)的國(guó)際合作相呼應(yīng)，1988年，美國(guó)的NBRF、日本的國(guó)際蛋白質(zhì)信息數(shù)據(jù)庫(kù)(Japane International Protein Information Databa，簡(jiǎn)稱JIPID)和德國(guó)的慕尼黑蛋白質(zhì)序列信息中心(Munich Information Center for Protein Sequences，簡(jiǎn)稱MIPS)合作成立了國(guó)際蛋白質(zhì)信息中心(PIR-International)，共同收集和維護(hù)蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)PIR，[Barker等, 2000]。