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            集群配置(Torque安裝配置+Maui安裝配置+SSH免驗證設置+節點共享目錄設置+硬盤空間及核心限制)異常詳細版

            更新時間:2023-06-07 10:09:25 閱讀: 評論:0

            集群配置(Torque安裝配置+Maui安裝配置+SSH免驗證設置+節點共享目錄設置+用戶硬盤空間限制和核心使用限制設置)異常詳細版
            制作者:甄江蘇
            單位:湘潭大學材料科學與工程
            本教程假設你已經在多臺電腦上安裝了CentOS 7.x 或RedHat 7.x版本的系統(建議每個機器上的root用戶登錄密碼相同),并且強烈建議安裝系統時選擇系統語言選擇英文。
            本教程主要分為這幾個方面:
            1.IP設置、計算機名稱設置及hosts文件修改
            2.SSH雙向免驗證登錄及其相關設置
            3.防火墻設置
            4.節點間共享文件夾(NFS服務)設置
            5.NIS服務設置
            6.Torque安裝及其設置
            7.Maui安裝及其設置
            8.用戶硬盤使用容量限制
            9.并行運行相關說明(比較重要!!!)
            1.IP設置、計算機名稱設置及hosts文件修改
            1.1IP設置(所有節點都要設置,只有主節點必須設置兩個,外網和內網):
            一般服務器電腦都有兩個網絡接口(至少主節點上面有兩個接口吧),我們可以把主節點上的一個網絡接口連接外網,以便在其他電腦上通過遠程ssh來進行相關操作,比如修改配置,提交任務等。另一個接口來連接內網,以便和其他子節點相互通信。外網IP是網絡管理中心分配的,內網IP可以自己分配。
            用圖形桌面的方式進入系統,點擊右上角,會看見網絡接口名稱(比如我的這個顯示enp2s0和enp3s0兩個接口),前提是你的兩個接口已經連上了網線。然后點擊進去,會看見關閉(或打開)選項和設置選項,點擊進去進行設置,我們現在先設置內網IP(我用enp2s0接口作為內網接口),像上面說的那樣選擇一個接口進
            去設置:
            進去后,點擊右下角的齒輪狀圖標進行設置,然后出現一個菜單,會發現左邊有6項,選擇第三項,進去后為左中下角的第一個“Connect automatically”打鉤,然后選擇左邊的第四個選項(也就是“IPV4”那個選項),然后選擇右上角的“ON”,“ON”的下邊那個(有DHCP的那個)用鼠標點擊一下,選擇中間的選
            項(“Manual”選項),然后在出來的地方填寫IP相關信息,第一行是IP地址,可以填比如:192.168.1.1(不能是192.168.1.0),其他節點可以是.2,.3……等;第二行是掩碼,所有節點都填寫:255.255.255.0;第三個是網關,可以填:192.168.1.1(所有節點網關都一樣),然后點擊應用就可以了,而外網IP跟上面的設置方法差不多,只不過是在連接外網的網絡接口里填寫由網絡管理中心給你的相關數據而已。
            假如你現在設置了兩臺電腦,內網ip分別為:192.168.1.1和192.168.1.2,你想知道這兩臺電腦之間能不能通過內網通信,直接在一臺機器上的終端執行:ping IP
            這里的IP是另一臺機器的ip,如果數據一行一行刷下來,然后再在另一臺機器上也像上面這樣做,如果也是一樣,說明兩臺機器能夠相互通信,如果卡住半天不動,說明有問題,自行百度解決。
            此外,這里順便設置一下網絡接口速度,設置成千兆的,不然可能會自動變成百兆的,降低節點間通信速度。先確定內網網絡接口,假如是enp2s0,然后利用root 權限執行:
            [root]# ethtool -s enp2s0 autoneg off speed 1000 duplex full
            注意,每臺計算機都按照上述方式設置一下。
            1.2修改計算機名稱:
            為每臺計算機修改適當的名稱,如node000,node001,node002……(如果在安裝系統時已經設定了指定的計算機名稱,那就不用設置了)
            如果是CentOS 7.x或者RedHat 7.x版本的linux系統,則用root權限運行命令修改:
            [root]# hostnamectl t-hostname node000
            然后用命令查看是不是修改了。
            [root]# hostname
            修改所有節點(包括主節點)的名稱,其他版本系統自行百度修改方法。
            1.3修改hosts文件:
            在主節點上用root權限修改/etc/hosts文件:
            [root]# vim /etc/hosts
            然后將本機的內網IP和所有其他節點(包括主節點)的IP填寫到最下邊,IP后面跟上對應的計算機名,計算機名后面也可以寫上別名,比如像這樣:
            192.168.1.1 node000 node0 #node0是別名,用于方便ssh管理其他節點192.168.1.2 node001 node1 #這樣后面就可以用ssh node1來登錄……#node001這個節點了
            后面設置了ssh免驗證登陸后要把這個hosts文件復制到所有子節點,稍后會在2.4節講。
            注意,node000是計算機的名稱,而這里的node0是別名,它就像一個變量一樣,代指IP地址,以后需要輸入這個IP的地方,直接用node0代替就行了。
            2.SSH雙向免驗證登錄及其相關設置
            如果想要多節點并行運行,必須讓各個節點間能夠通過ssh相互登錄且免驗證。方法:
            一個簡便的方法是在主節點上創建ssh密鑰和公鑰,然后將整個~/.ssh/這個文件夾拷貝到所有子節點相應位置即可,而對于設置了NIS服務的集群來說,除了root用戶需要拷貝外,其他用戶都不需要拷貝。
            2.1 創建ssh秘鑰:
            在主節點上的root用戶下,比如node000節點上,創建ssh秘鑰,在終端執行:[root]# ssh-keygen -t rsa
            然后一直確認下去。
            然后進入~/.ssh/文件夾下,制作授權文件:
            [root]# cd ~/.ssh/
            [root]# cp id_rsa.pub authorized_keys
            [root]# chmod 600 authorized_keys
            2.2 將ssh設置文件并拷貝到所有子節點:
            在主節點上的root用戶下,直接將剛才生成的~/.ssh/文件夾拷貝到所有子節點相應位置即可:
            [root]# scp -r ~/.ssh/ node1:~/
            [root]# scp -r ~/.ssh/ node2:~/
            [root]# scp -r ~/.ssh/ node3:~/
            ……
            在拷貝過程中會讓你選擇yes/no,統統選擇yes,然后讓你輸入你想拷貝的那個節點的root用戶的密碼,輸入就行了。
            上面的手動拷貝很麻煩,特別當節點很多時,需要不停地輸入密碼等等,這里可以用一個腳本實現自動輸入密碼和拷貝,非常快(這會用到expect命令,請自行百度)。
            弄好后,直接用ssh node1, ssh node2…..登錄各個節點時(雙向登錄都可以)無需輸入密碼時,就設置正確了。
            如果沒有NIS服務,則其他非root用戶想要實現免驗證登錄,也要像root用戶一樣這樣設置。
            2.3 有NIS服務時SSH免驗證登錄的設置(在設置NIS服務后設置非root用戶時進行此步設置,此外,在每次創建新用戶時也要執行此步設置):
            這一步建議先按照2.2的方式設置好root用戶的ssh免驗證登錄,然后根據第5節設置好NIS服務后,再按照本節設置其他非root用戶的ssh免驗證登錄。
            有NIS服務就不需要拷貝非root用戶的ssh設置文件了,但是root用戶的設置文件還是要向上面那樣設置。
            假設此時已經設置好root用戶的免驗證登錄和配置好NIS服務了,然后設置普通用戶的ssh免驗證登錄,此時只要設置主節點上的普通用戶就行了,并且子節點都根本不需要創建這個用戶。
            比如我在主節點上創建一個test用戶:

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